消化内科包括消化病区、消化内镜中心、消化专科门诊、炎症性肠病门诊，是惠州市临床重点专科、国家级上消化出血救治快速通道5星建设单位、国家消化道早癌防治中心联盟、广东省胃镜早癌精查联盟单位、幽门螺旋杆菌规范化诊治门诊市级示范中心、惠州市大肠癌筛查基地，拥有专业的医护团队共44人，其中高级职称7人，中级职称15人，学科带头人徐显林院长是惠州市名医。

消化内科病房占地面积1700平方米，设置病床共40张。消化内镜中心占地面积达2200平方米，设立8个操作间，按照国际标准建造。拥有5套目前最先进的奥林巴斯290系列电子胃肠镜和十二指肠镜，小儿胃镜，爱尔博电刀，高端内窥镜清洗消毒等专科设备，医疗配置达三甲医院水平。

心血管内科是惠州市临床重点专科，是惠州市胸痛中心联盟副主席单位，2017年在惠阳地区首家通过中国胸痛中心基层版认证，2020年通过中国胸痛中心标准版认证。心血管内科对心绞痛、心肌梗死、心衰、高血压、心脏瓣膜病、心律失常(心动过速、心动过缓、早搏、心房纤颤等)、心肌病、肾动脉狭窄等各种心血管疾病提供从筛查到治疗一体化服务，是本地区唯一有进口支架选择的医院，并独立设置CCU病房和导管室。

惠阳三和医院神经内科是集脑血管病急救、微创介入与神经系统疑难疾病诊疗于一体的科室。科室为惠州市临床重点专科，是深圳市第二人民医院脑病中心联盟单位、惠州市卒中联盟成员单位，也是惠州市首批加入中国“脑卒中救治地图”的单位。2020年，科室通过考核成为国家防治卒中中心;2025年，在广东省三级医院卒中中心现场指导中以高分顺利通过，获评“三级医院卒中中心”建设单位。

科室以脑卒中防治为核心技术优势，年神经介入手术量超350例，其中脑血管狭窄球囊扩张、支架植入等四级手术达100例以上;每年完成急性脑梗死静脉溶栓130例以上、取栓治疗50例以上。2024年，科室DNT中位数(入院至溶栓时间)为27分钟、DPT中位数(入院至穿刺时间)为101分钟，同年在全国二级卒中中心综合质量管理排名中获评A级。

在专病诊疗体系方面，科室着力打造“帕金森与认知障碍”及“头晕与偏头痛”两大特色亚专科，设有前庭功能评估中心并挂牌“头痛门诊”。通过多学科协作(MDT)模式，整合康复、药学、营养等专业资源，为患者提供从急性期救治、恢复期康复到长期健康管理的全程化“一站式”服务，全面守护区域民众的神经系统健康。

惠阳三和医院呼吸与危重症医学科是惠州市临床重点专科。科室高分通过国家PCCM规范化建设评审，成为惠阳区首家三级达标单位，慢性病管理体系建设与疑难危重症诊疗能力同步提升。

作为粤东首家规范化咳喘管理中心及惠州市首家睡眠医学中心，科室配备无创呼吸机、超声支气管镜及多导睡眠监测系统等先进设备，建立了睡眠呼吸疾病“筛查-诊断-治疗-随访”全程管理模式。此外，超声支气管镜引导下穿刺活检等呼吸介入技术达市级领先水平，有效减轻患者辗转外地就医的负担。

惠阳三和医院中医经典科是以中医经典方向创建的中医临床学科，是广东省中医院中医经典科专科联盟成员单位，2025年入选惠州市中医药重点专科建设项目，是集医疗、教学、科研于一体的综合学科。科室拥有22人专业团队(含7名硕士研究生)，环境温馨典雅，中医文化氛围浓厚，始终遵循“以病人为中心”的服务理念。科室开设“中医日间病房”，以舒适化治疗及纯中医中药治疗为特色，充分发挥中医药“简、便、验、廉”的优势，缩短患者无效住院时间，减轻经济负担。

医院普外科是惠阳区重点专科、惠州市临床重点专科培育发展项目、中华结直肠癌MDT联盟成员单位、中国医师协会外科医师分会疝和腹壁外科专委会主委陈双教授工作站。